Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPC6Q9Y625 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC6Q9Y625 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC6Q9Y625 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPC6Q9Y625 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms