Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA3Q9Y5J5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA3Q9Y5J5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA3Q9Y5J5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms