Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PCDHB13Q9Y5F0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB13Q9Y5F0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB13Q9Y5F0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms