Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL3Q9Y4R7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTLL3Q9Y4R7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL3Q9Y4R7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL3Q9Y4R7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms