Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC48.99■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC48.99■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC48.97■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC48.96■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.96■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC48.96■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC48.95■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC48.94■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.43
DCAF1Q9Y4B6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC48.91■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.91■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC48.89■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC48.88■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC48.88■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
DCAF1Q9Y4B6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC48.88■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC48.87■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC48.87■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC48.85■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48.84■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
DCAF1Q9Y4B6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC48.79■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
DCAF1Q9Y4B6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC48.74■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.39
DCAF1Q9Y4B6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC48.67■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC48.63■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
DCAF1Q9Y4B6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC48.62■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC48.61■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC48.6■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.6■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC48.58■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC48.58■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
DCAF1Q9Y4B6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC48.55■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
DCAF1Q9Y4B6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms