Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NR2E1Q9Y466 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR2E1Q9Y466 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR2E1Q9Y466 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms