Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KNSTRNQ9Y448 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KNSTRNQ9Y448 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNSTRNQ9Y448 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KNSTRNQ9Y448 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KNSTRNQ9Y448 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KNSTRNQ9Y448 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms