Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX24Q9Y343 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX24Q9Y343 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX24Q9Y343 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX24Q9Y343 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX24Q9Y343 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 470.5 ms