Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
THRAP3Q9Y2W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
THRAP3Q9Y2W1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
THRAP3Q9Y2W1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
THRAP3Q9Y2W1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms