Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3M1Q9Y2T2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M1Q9Y2T2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M1Q9Y2T2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms