Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP20Q9Y2K6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP20Q9Y2K6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP20Q9Y2K6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP20Q9Y2K6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms