Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ICE1Q9Y2F5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ICE1Q9Y2F5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ICE1Q9Y2F5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ICE1Q9Y2F5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms