Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1Q9Y2B5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS9D1Q9Y2B5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS9D1Q9Y2B5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS9D1Q9Y2B5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms