Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUDCQ9Y266 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUDCQ9Y266 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUDCQ9Y266 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NUDCQ9Y266 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUDCQ9Y266 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms