Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIGD1AQ9Y241 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIGD1AQ9Y241 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIGD1AQ9Y241 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms