Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC2Q9Y235 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC2Q9Y235 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC2Q9Y235 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms