Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Extl3Q9WVL6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Extl3Q9WVL6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Extl3Q9WVL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Extl3Q9WVL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Extl3Q9WVL6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms