Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lemd3Q9WU40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lemd3Q9WU40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lemd3Q9WU40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lemd3Q9WU40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lemd3Q9WU40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lemd3Q9WU40 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Lemd3Q9WU40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lemd3Q9WU40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms