Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD4AQ9UPU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD4AQ9UPU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms