Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP18Q9UMW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP18Q9UMW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP18Q9UMW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP18Q9UMW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
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