Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHTF1Q9UMS5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHTF1Q9UMS5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHTF1Q9UMS5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms