Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NRXN1Q9ULB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NRXN1Q9ULB1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NRXN1Q9ULB1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NRXN1Q9ULB1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NRXN1Q9ULB1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms