Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN2Q9UL51 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN2Q9UL51 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN2Q9UL51 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms