Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PARP4Q9UKK3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PARP4Q9UKK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PARP4Q9UKK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PARP4Q9UKK3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms