Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD3Q9UJU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD3Q9UJU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD3Q9UJU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms