Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCP2D1Q9UJQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCP2D1Q9UJQ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCP2D1Q9UJQ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms