Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR3Q9UJK0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR3Q9UJK0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms