Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
STAG3Q9UJ98 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
STAG3Q9UJ98 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
STAG3Q9UJ98 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms