Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABGEF1Q9UJ41 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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RABGEF1Q9UJ41 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGEF1Q9UJ41 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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