Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIX4Q9UIU6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIX4Q9UIU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIX4Q9UIU6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIX4Q9UIU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIX4Q9UIU6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms