Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HERC5Q9UII4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HERC5Q9UII4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERC5Q9UII4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HERC5Q9UII4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms