Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SS18L2Q9UHA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18L2Q9UHA2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18L2Q9UHA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms