Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODH2Q9UF12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRODH2Q9UF12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRODH2Q9UF12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms