Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLKQ9UBE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLKQ9UBE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms