Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sept6Q9R1T4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept6Q9R1T4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept6Q9R1T4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms