Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tk2Q9R088 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk2Q9R088 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk2Q9R088 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Tk2Q9R088 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tk2Q9R088 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms