Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb1bp2Q9R000 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb1bp2Q9R000 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb1bp2Q9R000 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb1bp2Q9R000 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms