Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc1Q9QZF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc1Q9QZF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc1Q9QZF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc1Q9QZF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms