Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VapbQ9QY76 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VapbQ9QY76 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VapbQ9QY76 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapbQ9QY76 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms