Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf354bQ9QXT9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf354bQ9QXT9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf354bQ9QXT9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354bQ9QXT9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf354bQ9QXT9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms