Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad18Q9QXK2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad18Q9QXK2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad18Q9QXK2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad18Q9QXK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms