Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00474Q9P2X8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00474Q9P2X8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00474Q9P2X8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms