Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC46.47■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC46.44■■■■■ 5.03
CC2D2AQ9P2K1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CC2D2AQ9P2K1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC46.33■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC46.32■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC46.32■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
CC2D2AQ9P2K1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC46.24■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
CC2D2AQ9P2K1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CC2D2AQ9P2K1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
CC2D2AQ9P2K1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms