Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.81■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.81■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.76■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
USP35Q9P2H5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
USP35Q9P2H5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP35Q9P2H5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP35Q9P2H5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP35Q9P2H5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms