Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD7Q9P2D1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHD7Q9P2D1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD7Q9P2D1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD7Q9P2D1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD7Q9P2D1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms