Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1BQ9P298 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1BQ9P298 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms