Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK12Q9NYV4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK12Q9NYV4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CDK12Q9NYV4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDK12Q9NYV4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK12Q9NYV4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms