Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC5A4Q9NY91 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC5A4Q9NY91 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A4Q9NY91 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC5A4Q9NY91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A4Q9NY91 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms