Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD3Q9NX63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHCHD3Q9NX63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHCHD3Q9NX63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms