Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RBM28Q9NW13 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM28Q9NW13 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM28Q9NW13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM28Q9NW13 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms